话说小智在取得了第七枚徽章之后，开始继续旅行。
至于最后一枚徽章，小智决定去红莲岛，向夏伯挑战，取得深红徽章。所以接下来的时间，可以说是比较充裕了，小智便不打算乘船去，而是打算走路到离那里最近的城市再去乘船。这一路上还可以增广见闻，训练小精灵，调查一些遗迹什么的，小智甚至问了一下大木博士最近有什么要研究的，自己可以顺便帮帮忙，结果就是月精灵被要了回去，顺便附赠太阳精灵、月精灵、叶精灵、冰精灵的进化方式报告，这让大木博士十分的激动，甚至联系七度灶博士一起研究。【这也导致七度灶博士后来一直对小智很感兴趣，小智去了新奥后，一度成为了他的“苦力”】
直到最近，小智才渐渐的从大木博士那里了解到，小精灵的研究是十分的枯燥与辛苦的，比如说小智提供的有关月精灵进化的消息，大木博士依旧要进行比对培养，直到实验结果出来了才能将这一猜想定论——这还是在小智提供了研究方向的情况下，如果让他们在毫无所知的情况下研究月精灵、太阳精灵的进化方式，恐怕会更加的复杂吧。
对此，小智利用电脑将自己所知的一些资料全部记录了下来，并且向大木博士请教了研究方式之后，尽可能的在旅行中做一些调查研究，并整理成资料或者报告交给大木博士，为他的提供论据。
小智的这一行为让大木博士对小智更加的看中了——毕竟小智总能找到一些有用的资料，这对他的研究帮助不小。于是对于平时小智的一些要求，更是全心全力的帮忙办好，两个人的关系从长辈与晚辈的关系，渐渐的变成了忘年交，甚至是同事（后来大木博士给小智申请了一个调查员的工作证，让小智成为了兼职研究员）。
这一段时间，小智他们在穿过了几座城市之后，来到了一个“特区”。这一带有很多的野生小精灵，并且受到官方保护，小智在询问过后，便让小刚帮忙买了不少的胶卷，自己更是买了不少的搜集装置（小智想要采集一些少见的药材），至于小霞，在小智的提醒下买了一些驱虫剂，在虫系小精灵多的地方，可以帮一下忙——虽然现在小霞已经渐渐克服了对虫的恐惧，但是依旧不是很喜欢，不过，这已经是很大的进步了。
在穿过了几个丛林之后，小智一行人来到了一片草原上，在这里他们看到了一群如同游牧民族的人，小智隐约的记得好像在这里，有个女孩子因为同村的对手暗算，结果无法参加比赛，最后自己不得不去参加——想到这里，小智觉得还是算了吧，既然自己预先知道，那么就帮忙提早预防吧，要不然那个女孩子心中恐怕还是有些遗憾的。
之后，小智果然遇到了那个温和有礼的女孩子以及她的小火马。
好客的她邀请小智去他们家做客，小智自然是笑着答应了，在那个机关发动的时候，小智赶紧将她推了开去，可是不小心自己却受伤了。
见到这一结果，小智真是欲哭无泪——自己难得大发善心，结果却让自己遭了无妄之灾，真是……想到那个阴险的男的，小智心中就气不打一处来，决定要插手这场赛事，好好的教训他。
于是，这几天小智便跟女孩子一起训练小火马。
一开始对于小智女孩子只是有些愧疚所以让他插手训练，但是看到小智也并没有不懂装懂，并且告诉了她利用小火马的引火特性，吞下火系绝招长出翅膀来飞翔，她便对小智大为赞赏，就连一边的小刚和小霞也觉得很厉害。小火马甚至让小智坐在身上，在天空中飞了一圈（小智一直梦想着坐一下天马）。
之后的赛跑，女孩自然是毫无疑问的获得了冠军，即使是在半路上那个骑着嘟嘟利的男子再次用阴招，小火马依旧利用火焰之翼赶超了回来，并在天空之中进化为烈焰马。
告别了他们，小智一行人继续的踏上了旅途，并且在路上遇到了袋龙一族，以及那有些脱线的一家子。
看到他们一家人与袋龙幸福的生活在一起，小智不禁为亲情而感动，并且想起了在家中的母亲。于是这一次到达了小精灵中心之后，小智跟家里打电话的时间比以往明显长了不少。
之后，小智他们便在一阵紧赶慢赶中，到了野生原野区。
在这里，火爆的凯撒先生一阵枪林弹雨给他们来了一个别开生面的欢迎仪式，小智无语的看着前面手忙脚乱的两个人，满头黑线。
幸好自己提前放出了月精灵（前几天刚回来的），并让他用保护防御好了，否则自己也要倒霉吧。
一番兵荒马乱之后，小智等人各带着30个原野球，进入了野生原野区。
小智观察了一下周围的小精灵，发现大多都是那种比较温顺的小精灵，想来应该不适合战斗，所以并没有打算收服，至于肯泰罗，小智事先已经和大木博士说好了，要寄过去10只，这样有助于研究所的外围防护。
最后考虑到这里的风景不错，自己的小精灵们好久没有放松了，便回到凯撒先生那里，交还了剩下的20 个精灵球，跟他告备了一声，便将10个精灵球传送给了大木博士，并且传过去了自己最近的研究资料。
之后，便放出了自己所有的小精灵，带着他们一起到一片小湖旁，尽情的玩耍。小智也不再做别的，跟着自己的小精灵一起玩闹了起来。小霞看到了这里的情形，也将自己的小精灵放了出来，并且在湖边开始钓鱼。
过了一会，小刚补充了几只小精灵后，也加入了小智他们，不过身为饲育家的他，还要负担起众人的食物。
值得一说的是，小霞在附近收服了一只可爱的伊布，打算培养成一只水精灵。考虑到目前还没有训练好，所以也就并没有急着让它进化，不过后来到了史顿镇，遇到了伊布四兄弟之后，在那里终于得偿所愿。
没有想到的是，火箭队的三人组突然出现了，看到他们鬼鬼祟祟的样子，小智突然想起这里好像有一只迷你龙和一只哈克龙，便猜到他们大概是从凯撒先生那里知道了什么，便悄悄的跟上去。
当来到了龙之谷后，小智便悄悄地隐藏起来，观察着事态的发展。想起一会儿将有一场大战，小智便将自己的电脑取出，摄像头等研究设备安置好，并对这里面的3D龙说：“小家伙，一会儿我要搜集战斗资料，就麻烦你帮我操控了。”
屏幕中的3D龙笑眯眯的摆了一个“OK”的造型，表示自己知道了。说起来，3D龙完全成为了小智研究时的私人助理了。
就在火箭队扔出催眠弹的时候，小智让飞天螳螂和比比鸟出手了。飞天螳螂挡住了双蛋瓦斯和阿柏怪，比比鸟截下了催眠弹。迷你龙受惊之下窜回了水中，大概是找他的母亲去了。很明显，火箭队的这一举动，惹怒了哈克龙，有着雨神之称、擅长控制天气的哈克龙横空出世，一阵龙卷风卷飞了火箭队三人组，打斗造成的燃烧之火，也被哈克龙的求雨给浇灭了。
看到再次出现的好友，凯撒先生泪流满面，相拥良久。
后来，凯撒先生告诉了小智他与哈克龙的故事，并且叮嘱小智不要将哈克龙的事情说出去，免得造成野生原野区引来更多的麻烦。
对于凯撒先生的担忧，小智表示理解，答应保密这一消息。作为感谢，凯撒先生答应了小智想要观察哈克龙和迷你龙的请求。由于为了保密，小智便没有进行拍摄和录像，而是用观察家的绘画方式，进行了记录。
之后，小智更是与哈克龙、迷你龙母子俩一起玩了许久，还让比比鸟、蚊香蛙等小精灵一起向哈克龙学习招式。在哈克龙的帮助下，蚊香蛙的一些水系绝招都有了很大的进展，祈雨的时效也延长了很多。比比鸟的龙卷风运用得更加的得心应手，以后进行组合技的时候，成功率会提高不少。
最后，小智抓了一只大舌贝之后，便返回队伍了，龙之谷的上空，隐藏于彩虹之中的哈克龙母子，默默的凝视着小智与凯撒远去的身影。
看到小智归来，小霞关心的询问：“到底发生什么事了？”
“没什么，只是看到火箭队的来捣乱，我就把他们赶跑了。”
“真是的，这些家伙还真是阴魂不散！”
“真的只是这样吗？怎么用了这么长的时间？”小刚不解的问。
“没什么，只是我又抓了一只小精灵。”小智将其递给小霞，“这是一个大舌贝，你可以用它进化成铁甲贝。我的那个打算让它与呆呆兽一起进化成河马王。”
“是这样啊，到时候记得给我看看。”小霞高兴的接过精灵球，开心的说。
“没有问题。”