公元2099年。
世界的科技经济达到了前所未有的水平，然而伴随着时代的飞速发展而来的却是不可再生能源的接近枯竭和生态环境的严重恶化。
公元2100年。
传统可再生能源已经无法满足日益膨胀的人类社会的需求，环境污染严重影响了人类生活。为了建设更好的生存环境，为了实现人类社会的可持续发展，各国抽调出最优秀的科学家组成科考团，分组进行新能源的开发工作。
公元2101年。
一支科考队在南极大陆腹地意外发现一种神秘的物质，引起了全世界的关注。各国纷纷对该物质进行研究，最后因其表面释放出强大的反物质能量而命名为“反物质之核”。反物质之核具有威力大、时效快、污染极小等优点，逐渐替代了旧能源，成为世界标准新能源，人类迎来了环保的反物质之核时代。
公元2102年。
生态环境得到改善，世界继续向前发展。然而好景不长，联合国的一个科研所在对反物质之核进行研究时，意外发生了一场大爆炸，随后一股超级能量瞬间席卷全球。反物质之核能量的泄露，引发了一系列问题：地球磁场变强，自然灾害频发，有些地区疑似出现时空裂缝……
公元2105年。
各国开发取代反物质之核的能源的计划相继宣告失败，反物质之核能量的泄露的连锁反应还在继续。为了在新时代下谋求生存，第三次世界大战由此爆发。
公元2106年。
能源战争促使世界更加混乱不堪，反物质之核逐渐战争化。各国陷入恐慌之中，纷纷对反物质之核技术进行封锁。然而战争已经失去控制，最终在太平洋战场上彻底爆发。大陆大洋撕裂重组，地震海啸达到了有史以来的最高级，全世界超过几十亿的人类遇难……
公元2107年。
反物质之核能量的辐射导致生物变异，植物动物成为各种怪兽，人类感染未知病毒后成为变异体。变异体一部分由死尸蜕变而成，多数行动迟缓、无自主意识，称之为僵尸；另一部分由活人基因突变而成，行动迅猛、有一定智慧，称之为丧尸。世界各地均出现了变异体袭击人类的事件，人类不得不划分出隔离区以防范变异体的入侵。数月之后，人类又发现了血族（吸血鬼）和影族（审判者）等更加强大具有更多智慧的高级变异体。幸存下来的人类开始寻找解决问题的办法，于是“特工”就这样产生了。
公元2108年。
各国签订联合国和平协议，大规模杀伤武器被禁止。虽然千疮百孔的地球仍然处于危险之中，但是所幸没有大规模世界战争的爆发。一些掌握着新科技的财团处于垄断地位，疯狂地掠夺着地球上所剩的资源。由于垄断财团具有得天独厚的条件，“基因锁”这种新型军备便应运而生。基因锁作为一项超时代科技，它能使人的身体机能在各个方面都得到强化，具有非同凡响的能力，几乎可以应对各种情况。于是各大势力争先恐后创办特工学校，建立特工组织。这意味着拥有特工数量越多，基因锁力量越强大，垄断反物质之核的势力生存几率越高。不久之后，特工模拟系统问世。特工模拟系统就是一种全息模拟技术，与特工身体的神经系统进行连接，能让特工对战争有身临其境的感觉却又不会真的受伤，只不过会有疼痛感并且分等级。
公元2121年。
迫于生存压力，联合国转变为集政治、经济、军事为一体的特工联盟，各国不得不将反物质之核的掌握权上交给特工联盟。特工联盟总部设立在中立洲格里夫兰，最高指挥官由中立洲选举产生。为了有能力对抗大规模变异体入侵，特工联盟开展了天梯赛来选拔最顶尖的特工。
公元2516年。
数百年过去了，地球也渐渐恢复了元气。在新能源的支撑之下，一些国家开始了太空移民。由于变异体仍然在威胁着人类，特工数量已经达到总人类的30％。世界看似一派和平，实则处处潜藏危机。
我们的故事，从这里开始。